Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f4P62515 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f4P62515 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f4P62515 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f4P62515 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f4P62515 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f4P62515 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f4P62515 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f4P62515 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f4P62515 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f4P62515 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f4P62515 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f4P62515 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f4P62515 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f4P62515 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f4P62515 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f4P62515 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f4P62515 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f4P62515 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f4P62515 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f4P62515 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou3f4P62515 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Pou3f4P62515 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms