Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms