Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm3P62311 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms