Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufm1P61961 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms