Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copz1P61924 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copz1P61924 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copz1P61924 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copz1P61924 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copz1P61924 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copz1P61924 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copz1P61924 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Copz1P61924 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copz1P61924 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copz1P61924 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Copz1P61924 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copz1P61924 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms