Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga11P61622 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga11P61622 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga11P61622 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga11P61622 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga11P61622 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga11P61622 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga11P61622 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms