Protein–RNA interactions for Protein: P58281

Opa1, Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa1P58281 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa1P58281 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa1P58281 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opa1P58281 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opa1P58281 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opa1P58281 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opa1P58281 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opa1P58281 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opa1P58281 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opa1P58281 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms