Protein–RNA interactions for Protein: P57780

Actn4, Alpha-actinin-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn4P57780 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn4P57780 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn4P57780 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn4P57780 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn4P57780 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actn4P57780 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms