Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samsn1P57725 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Samsn1P57725 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms