Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn18P56857 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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