Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdcd5P56812 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdcd5P56812 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.7 ms