Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rp1P56716 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rp1P56716 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rp1P56716 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rp1P56716 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rp1P56716 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rp1P56716 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rp1P56716 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rp1P56716 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rp1P56716 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Rp1P56716 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rp1P56716 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rp1P56716 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rp1P56716 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rp1P56716 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rp1P56716 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rp1P56716 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rp1P56716 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rp1P56716 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rp1P56716 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rp1P56716 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rp1P56716 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rp1P56716 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rp1P56716 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rp1P56716 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rp1P56716 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rp1P56716 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rp1P56716 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rp1P56716 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rp1P56716 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rp1P56716 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rp1P56716 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rp1P56716 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms