Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd38P56528 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd38P56528 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd38P56528 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd38P56528 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd38P56528 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd38P56528 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd38P56528 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd38P56528 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms