Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gp1bbP56400 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms