Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Faf1P54731 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Faf1P54731 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Faf1P54731 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms