Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.8
Map3k1P53349 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Map3k1P53349 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms