Protein–RNA interactions for Protein: P51885

Lum, Lumican, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LumP51885 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LumP51885 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LumP51885 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LumP51885 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LumP51885 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LumP51885 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LumP51885 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LumP51885 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LumP51885 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LumP51885 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LumP51885 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LumP51885 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LumP51885 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LumP51885 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LumP51885 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LumP51885 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LumP51885 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LumP51885 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LumP51885 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LumP51885 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LumP51885 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LumP51885 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LumP51885 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LumP51885 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LumP51885 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LumP51885 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LumP51885 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LumP51885 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LumP51885 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LumP51885 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LumP51885 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LumP51885 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LumP51885 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LumP51885 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LumP51885 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LumP51885 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LumP51885 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LumP51885 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LumP51885 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LumP51885 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LumP51885 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LumP51885 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LumP51885 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LumP51885 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LumP51885 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LumP51885 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LumP51885 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LumP51885 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LumP51885 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LumP51885 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LumP51885 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LumP51885 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LumP51885 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LumP51885 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LumP51885 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LumP51885 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LumP51885 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LumP51885 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LumP51885 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LumP51885 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LumP51885 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LumP51885 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LumP51885 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LumP51885 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LumP51885 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LumP51885 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LumP51885 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LumP51885 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LumP51885 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LumP51885 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LumP51885 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LumP51885 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LumP51885 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LumP51885 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LumP51885 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LumP51885 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LumP51885 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LumP51885 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LumP51885 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LumP51885 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LumP51885 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LumP51885 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LumP51885 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LumP51885 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LumP51885 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LumP51885 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LumP51885 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LumP51885 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LumP51885 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LumP51885 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LumP51885 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LumP51885 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LumP51885 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LumP51885 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LumP51885 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LumP51885 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LumP51885 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LumP51885 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LumP51885 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LumP51885 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms