Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa8P50706 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa8P50706 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa8P50706 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa8P50706 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms