Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SftpdP50404 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SftpdP50404 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SftpdP50404 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SftpdP50404 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SftpdP50404 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SftpdP50404 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SftpdP50404 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SftpdP50404 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SftpdP50404 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SftpdP50404 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms