Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Psen1P49769 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Psen1P49769 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psen1P49769 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psen1P49769 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psen1P49769 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psen1P49769 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psen1P49769 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms