Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox2P48432 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox2P48432 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox2P48432 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox2P48432 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox2P48432 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox2P48432 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms