Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl5P47962 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl5P47962 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms