Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CratP47934 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CratP47934 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CratP47934 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CratP47934 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CratP47934 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CratP47934 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CratP47934 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CratP47934 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CratP47934 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CratP47934 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CratP47934 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CratP47934 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CratP47934 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CratP47934 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CratP47934 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CratP47934 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CratP47934 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CratP47934 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CratP47934 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CratP47934 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CratP47934 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CratP47934 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CratP47934 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CratP47934 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CratP47934 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CratP47934 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CratP47934 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CratP47934 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CratP47934 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CratP47934 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CratP47934 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CratP47934 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CratP47934 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CratP47934 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CratP47934 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CratP47934 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CratP47934 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CratP47934 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CratP47934 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CratP47934 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CratP47934 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CratP47934 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CratP47934 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CratP47934 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CratP47934 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CratP47934 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CratP47934 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CratP47934 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CratP47934 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CratP47934 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CratP47934 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CratP47934 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CratP47934 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CratP47934 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CratP47934 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CratP47934 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CratP47934 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CratP47934 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CratP47934 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CratP47934 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CratP47934 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CratP47934 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CratP47934 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CratP47934 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CratP47934 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CratP47934 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CratP47934 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CratP47934 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CratP47934 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CratP47934 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CratP47934 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CratP47934 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CratP47934 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CratP47934 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CratP47934 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CratP47934 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CratP47934 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CratP47934 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CratP47934 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CratP47934 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CratP47934 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CratP47934 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CratP47934 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CratP47934 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CratP47934 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CratP47934 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CratP47934 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CratP47934 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CratP47934 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CratP47934 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CratP47934 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CratP47934 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CratP47934 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CratP47934 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CratP47934 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CratP47934 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CratP47934 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CratP47934 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CratP47934 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms