Protein–RNA interactions for Protein: P47753

Capza1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza1P47753 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capza1P47753 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capza1P47753 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capza1P47753 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capza1P47753 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capza1P47753 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Capza1P47753 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capza1P47753 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Capza1P47753 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capza1P47753 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capza1P47753 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capza1P47753 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capza1P47753 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capza1P47753 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Capza1P47753 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Capza1P47753 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capza1P47753 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capza1P47753 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Capza1P47753 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capza1P47753 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capza1P47753 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capza1P47753 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Capza1P47753 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza1P47753 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza1P47753 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza1P47753 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Capza1P47753 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza1P47753 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza1P47753 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza1P47753 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza1P47753 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Capza1P47753 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Capza1P47753 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Capza1P47753 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Capza1P47753 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza1P47753 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza1P47753 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza1P47753 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza1P47753 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza1P47753 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza1P47753 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza1P47753 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza1P47753 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza1P47753 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capza1P47753 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Capza1P47753 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza1P47753 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza1P47753 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms