Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax7P47239 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax7P47239 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax7P47239 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax7P47239 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax7P47239 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax7P47239 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax7P47239 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax7P47239 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax7P47239 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax7P47239 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms