Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zic1P46684 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zic1P46684 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zic1P46684 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic1P46684 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic1P46684 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms