Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sept1P42209 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sept1P42209 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sept1P42209 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sept1P42209 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sept1P42209 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sept1P42209 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sept1P42209 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sept1P42209 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sept1P42209 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sept1P42209 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sept1P42209 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sept1P42209 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sept1P42209 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sept1P42209 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms