Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tac1P41539 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tac1P41539 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tac1P41539 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tac1P41539 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tac1P41539 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tac1P41539 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tac1P41539 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tac1P41539 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tac1P41539 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tac1P41539 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tac1P41539 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tac1P41539 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tac1P41539 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tac1P41539 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tac1P41539 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tac1P41539 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tac1P41539 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tac1P41539 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tac1P41539 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tac1P41539 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tac1P41539 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tac1P41539 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tac1P41539 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms