Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf1P39428 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf1P39428 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf1P39428 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf1P39428 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf1P39428 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf1P39428 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf1P39428 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf1P39428 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf1P39428 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms