Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col18a1P39061 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms