Protein–RNA interactions for Protein: P35441

Thbs1, Thrombospondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs1P35441 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thbs1P35441 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs1P35441 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs1P35441 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs1P35441 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs1P35441 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs1P35441 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs1P35441 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs1P35441 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs1P35441 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs1P35441 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs1P35441 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs1P35441 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs1P35441 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs1P35441 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs1P35441 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs1P35441 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs1P35441 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs1P35441 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs1P35441 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs1P35441 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs1P35441 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms