Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Saa4P31532 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Saa4P31532 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Saa4P31532 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Saa4P31532 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Saa4P31532 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Saa4P31532 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Saa4P31532 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Saa4P31532 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Saa4P31532 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms