Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnd1P30999 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms