Protein–RNA interactions for Protein: P30557

Ptger3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptger3P30557 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptger3P30557 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptger3P30557 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms