Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msr1P30204 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msr1P30204 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msr1P30204 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msr1P30204 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msr1P30204 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msr1P30204 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msr1P30204 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msr1P30204 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msr1P30204 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Msr1P30204 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms