Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mmp3P28862 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms