Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrgP28705 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RxrgP28705 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RxrgP28705 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RxrgP28705 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms