Protein–RNA interactions for Protein: P28654

Dcn, Decorin, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcnP28654 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcnP28654 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcnP28654 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DcnP28654 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcnP28654 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcnP28654 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcnP28654 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcnP28654 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcnP28654 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcnP28654 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcnP28654 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcnP28654 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcnP28654 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DcnP28654 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcnP28654 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DcnP28654 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DcnP28654 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcnP28654 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcnP28654 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcnP28654 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcnP28654 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcnP28654 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DcnP28654 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcnP28654 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcnP28654 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcnP28654 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcnP28654 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcnP28654 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcnP28654 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcnP28654 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DcnP28654 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcnP28654 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcnP28654 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DcnP28654 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DcnP28654 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DcnP28654 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DcnP28654 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DcnP28654 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DcnP28654 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DcnP28654 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DcnP28654 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DcnP28654 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DcnP28654 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DcnP28654 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DcnP28654 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DcnP28654 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DcnP28654 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DcnP28654 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DcnP28654 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DcnP28654 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DcnP28654 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DcnP28654 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DcnP28654 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DcnP28654 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DcnP28654 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DcnP28654 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DcnP28654 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DcnP28654 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DcnP28654 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DcnP28654 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DcnP28654 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DcnP28654 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DcnP28654 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DcnP28654 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DcnP28654 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DcnP28654 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DcnP28654 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DcnP28654 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DcnP28654 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DcnP28654 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DcnP28654 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DcnP28654 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DcnP28654 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DcnP28654 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DcnP28654 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DcnP28654 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DcnP28654 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DcnP28654 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DcnP28654 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DcnP28654 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DcnP28654 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DcnP28654 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DcnP28654 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DcnP28654 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DcnP28654 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DcnP28654 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DcnP28654 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DcnP28654 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DcnP28654 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DcnP28654 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DcnP28654 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DcnP28654 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DcnP28654 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DcnP28654 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DcnP28654 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DcnP28654 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DcnP28654 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DcnP28654 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DcnP28654 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DcnP28654 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms