Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa5P28312 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa5P28312 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa5P28312 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa5P28312 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa5P28312 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa5P28312 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms