Protein–RNA interactions for Protein: P28311

Defa4, Alpha-defensin 4, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa4P28311 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa4P28311 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Defa4P28311 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms