Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjc1P28229 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjc1P28229 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms