Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkchP23298 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkchP23298 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkchP23298 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkchP23298 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkchP23298 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PrkchP23298 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrkchP23298 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrkchP23298 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrkchP23298 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrkchP23298 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrkchP23298 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PrkchP23298 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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