Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnnc2P20801 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms