Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb9P20615 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb9P20615 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms