Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfaP20033 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms