Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox5bP19536 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms