Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RargP18911 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RargP18911 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RargP18911 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RargP18911 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RargP18911 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RargP18911 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RargP18911 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RargP18911 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RargP18911 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RargP18911 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RargP18911 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RargP18911 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RargP18911 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RargP18911 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RargP18911 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RargP18911 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RargP18911 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RargP18911 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RargP18911 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RargP18911 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RargP18911 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RargP18911 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RargP18911 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RargP18911 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RargP18911 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RargP18911 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RargP18911 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RargP18911 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RargP18911 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RargP18911 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RargP18911 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RargP18911 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RargP18911 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RargP18911 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RargP18911 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RargP18911 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RargP18911 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RargP18911 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RargP18911 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RargP18911 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RargP18911 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RargP18911 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RargP18911 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RargP18911 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RargP18911 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RargP18911 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RargP18911 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RargP18911 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RargP18911 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RargP18911 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RargP18911 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RargP18911 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RargP18911 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RargP18911 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RargP18911 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RargP18911 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RargP18911 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RargP18911 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RargP18911 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RargP18911 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RargP18911 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RargP18911 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RargP18911 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RargP18911 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RargP18911 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RargP18911 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RargP18911 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RargP18911 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RargP18911 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RargP18911 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RargP18911 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RargP18911 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RargP18911 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RargP18911 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RargP18911 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RargP18911 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RargP18911 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RargP18911 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RargP18911 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RargP18911 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RargP18911 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RargP18911 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RargP18911 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RargP18911 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RargP18911 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RargP18911 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RargP18911 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RargP18911 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RargP18911 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RargP18911 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RargP18911 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RargP18911 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RargP18911 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RargP18911 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RargP18911 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RargP18911 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RargP18911 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RargP18911 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RargP18911 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms