Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps6ka1P18653 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps6ka1P18653 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms