Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18524 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18524 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18524 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18524 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18524 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18524 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18524 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18524 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18524 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18524 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18524 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18524 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18524 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18524 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18524 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P18524 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18524 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18524 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18524 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18524 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18524 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18524 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18524 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18524 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18524 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18524 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18524 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18524 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18524 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18524 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18524 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18524 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18524 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18524 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18524 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18524 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18524 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18524 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18524 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18524 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18524 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18524 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18524 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18524 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18524 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18524 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18524 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18524 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18524 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18524 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18524 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P18524 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18524 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P18524 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18524 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P18524 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18524 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18524 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18524 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18524 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18524 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18524 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18524 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18524 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18524 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18524 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18524 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18524 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18524 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18524 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18524 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18524 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18524 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P18524 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P18524 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18524 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18524 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18524 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18524 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18524 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18524 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18524 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P18524 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18524 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18524 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18524 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18524 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18524 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18524 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18524 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P18524 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18524 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18524 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18524 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18524 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18524 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18524 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18524 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18524 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms