Protein–RNA interactions for Protein: P15375

Myf6, Myogenic factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf6P15375 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Myf6P15375 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myf6P15375 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myf6P15375 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myf6P15375 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myf6P15375 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Myf6P15375 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Myf6P15375 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Myf6P15375 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Myf6P15375 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myf6P15375 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myf6P15375 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Myf6P15375 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myf6P15375 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myf6P15375 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myf6P15375 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myf6P15375 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myf6P15375 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myf6P15375 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myf6P15375 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myf6P15375 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myf6P15375 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myf6P15375 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myf6P15375 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myf6P15375 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myf6P15375 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myf6P15375 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myf6P15375 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Myf6P15375 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms